GenNext^® NGS Library Prep Kit -KODEasy^®-

● DNA测序（DNA-seq）文库制备

说明

GenNext^® NGS Library Prep Kit -KODEasy^®是一款可从片段化的双链DNA（如超声片段化/酶切片段化基因组DNA等）或PCR产物等样品中，简便且快速地制备Illumina公司二代测序仪用文库的试剂盒。

● 操作便利性提升

添加试剂体积＞3 μL，操作方便，易于实现自动化，可获得高重现性。

 ● 低偏差扩增

文库扩增采用独特的PCR酶（UKOD DNA聚合酶）。

即使对AT富集或GC富集的靶标也能获得良好的扩增效果，可实现低偏差的文库扩增。 

● 单管反应

从末端修复到文库扩增均在单管中进行，操作简便，可防止样品混淆。 

● 仅需1次纯化

纯化步骤仅需1次，操作简便，易于实现高通量处理。

可控制样品损失，大幅减少吸头等耗材的使用。

1. 文库分布及收量的比较

从超声片段化处理（平均链长200 bp）的人基因组DNA、HB8（Tth）基因组DNA 10 ng中，使用GenNext^® NGS Library Prep Kit -KODEasy^®及其他公司文库制备试剂盒制备文库，比较了文库分布、收量及接头二聚体浓度。PCR进行8个循环。

结果显示，本产品在文库大小分布上与其他公司试剂相当，文库收量与其他公司相比达到同等或以上水平，接头二聚体浓度也显示同等结果。所有样品均获得了可用于Illumina公司测序仪所需的4 nM以上收量。

2. 文库覆盖度均一性的确认

从超声片段化处理（平均链长200 bp）的Thermus thermophilus HB8（Tth）基因组DNA 10 ng中，使用GenNext^® NGS Library Prep Kit -KODEasy^®制备文库，确认了不同GC含量区域的覆盖度。

PCR进行8个循环，测序使用MiSeq^®（Illumina公司）进行。

结果显示，即使对GC含量70%以上的区域也显示出高检出率。

3. 从各种平均链长输入样品制备文库

从超声片段化处理（平均链长300 bp及约500 bp）的人基因组DNA 10 ng中，使用GenNext^® NGS Library Prep Kit -KODEasy^®制备文库，比较了文库分布、收量及接头二聚体浓度。PCR进行8个循环。

结果显示，即使使用不同大小的基因组DNA作为输入DNA，所有样品均获得了可用于Illumina公司测序仪所需的4 nM以上收量。 

4. 从各种量输入DNA制备文库

从超声片段化处理（平均链长约200 bp）的人基因组DNA 10 ng、100 ng及200 ng中，使用GenNext^® NGS Library Prep Kit -KODEasy^®制备文库，比较了文库分布、收量及接头二聚体浓度。PCR进行5个循环。

结果显示，即使从不同输入量的基因组DNA中，所有样品均获得了可用于Illumina公司测序仪所需的4 nM以上收量。

5. NGS比对率、插入片段大小的比较

从超声片段化处理（平均链长约200 bp）的人基因组DNA 10 ng中，使用GenNext^® NGS Library Prep Kit -KODEasy^®制备文库，比较了比对率及插入片段大小。PCR进行8个循环，测序使用MiSeq^®（Illumina公司）进行。

结果显示，获得了与纯化步骤较多的其他公司试剂同等的比对率和插入片段大小。

6. 混合微生物基因组DNA的测序

从混合微生物基因组DNA（ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard II（Log Distribution），Zymo Research公司）10 ng中，使用GenNext^® NGS Library Prep Kit -KODEasy^®制备文库，计数了比对后的读段数。PCR进行8个循环，测序使用MiSeq^®（Illumina公司）进行。

结果显示，理论值与实测读段数显示出高相关性（决定系数（R²）= 0.97）。